Часто використовується сконструйована кДНК для експресії специфічного білка в клітині, яка зазвичай не експресує цей білок (тобто гетерологічна експресія), або для секвенування або кількісного визначення молекул мРНК за допомогою методів на основі ДНК (qPCR, RNA-seq).
кДНК (скорочення від копійної ДНК; також називається комплементарною ДНК) є синтетична ДНК, яка була транскрибована зі специфічної мРНК за допомогою реакції з використанням ферменту зворотної транскриптази. Хоча ДНК складається як з кодуючих, так і з некодуючих послідовностей, кДНК містить лише кодуючі послідовності.
кДНК є більш зручним способом роботи з кодуючою послідовністю, ніж мРНК, оскільки РНК дуже легко розщеплюється всюдисущими РНКазами.. Це основна причина секвенування кДНК, а не мРНК. Подібним чином дослідники, які проводять мікрочипи ДНК, часто перетворюють мРНК у кДНК, щоб виробляти свої зонди.
Використовуючи той самий модифікований праймер у ПЛР-ампліфікації, ампліфікується лише матриця кДНК, оскільки матриця геномної ДНК частково гетерологічна до праймера. Таким чином, на ампліфікацію за допомогою ПЛР не впливає будь-яке потенційне забруднення ДНК, оскільки воно є специфічним лише для матриці кДНК.
мРНК більш крихка, ніж ДНК, що ускладнює обробку та аналіз. Щоб вирішити цю проблему, дослідники часто перетворюють зразки мРНК у комплементарні послідовності ДНК, або кДНК. Це робиться шляхом зворотного природного процесу, який клітина використовує для створення мРНК з ДНК, методом, відомим як зворотна транскрипція.
Синтез кДНК є корисний інструмент для вивчення експресії генів у безлічі організмів. Крім того, вони використовуються для експресії тисяч генів для скринінгу поліморфізму, картування клонів геномної ДНК і великомасштабного відкриття генів.