Набір Illumina DNA Prep Kit забезпечує однорідні та узгоджені розміри вставок (300–350 п.о), у широкому діапазоні введення ДНК (1–500 нг) (рис. 3). 2 листопада 2016 р.
Стандартні бібліотеки секвенування Illumina від 200 до 500 bp наразі зазвичай мають розмір фрагмента від 200 до 500 bp, за винятком адаптерів (див. Базовий протокол 1).');})();(function(){window.jsl.dh('qDPUZtvZCJTl5NoP-JyTOQ__29','
Середні розміри є 429 bp і 458 bp, відповідно. Оскільки адаптери вносять ~150 bp в кінцевий розмір бібліотеки, довжина вставки становить 279 bp і 308 bp відповідно.
Яка довжина амплікону? Усі панелі On-Demand мають максимальний розмір амплікона 275 б.
Поширені запитання: які розміри фрагментів РНК рекомендовано для секвенування наступного покоління (NGS)? Рекомендовані розміри фрагментів РНК відрізняються для різних платформ NGS. Illumina® і SOLiD® рекомендують фрагмент РНК до 200 нуклеотидів. 454 Life Sciences рекомендує розподіл розмірів між довжинами нуклеотидів 450-1200.
З цієї інформації ви знаєте фрагмент принаймні 5070 bp за розміром, плюс цей маленький додатковий шматочок між місцем розрізу XhoI (5198 bp) і кінцем плазміди (5360 bp). Ви можете легко обчислити цей невеликий шматок фрагмента таким чином: 5360 bp – 5198 bp = 162 bp.